石佛寺在武功县南仁乡下寨村东北角，占地百餘亩，东北依塬，南临渭水，西邻武功县城。传说唐时下寨村民眾在村南垦荒时，无意间挖出一尊北魏时期的石佛像，民眾在惊愕之中诚惶诚恐。后经智者点拨，民眾才将石佛身请了出来。随后捐款建寺，供奉石佛。1164年，金世宗曾赦赐“吉祥院”，后人称其石佛寺。

又说五代时，后周大将赵匡胤率眾作战失利逃至此地，夜半，追兵忽然赶来，战士们都似被施了魔法一般沉沉睡去，无一人可以应战，赵匡胤无奈，挥起手中金杵，这时院外忽然电闪雷鸣，天空被照得宛如白昼，金色的光从他手中金杵照向寺门上方，石佛寺驀地变成了“夻”佛寺。追兵们以為追错了方向，正欲改变方向追杀时，大雨猛然停了，佛光普照。寺外的追兵们被眼前的景象所撼，纷纷丢下武器，跪地磕头，求佛祖保佑。赵匡胤在寺里听到外面的拜佛声，不知何故，便在几个将士的保护下出了寺院，方知刚才佛祖显灵。赵匡胤得此庇佑，后多次下旨重修石佛寺，院址20多亩，又将院外的280多亩土地划归石佛寺。宋太祖当年的饮马石槽一直保存到上世纪五十年代。

解放后，石佛寺被改為学校，分為小学和初中两部。可惜十年浩劫，石佛寺的所有殿堂毁于一旦。

现在寺院的殿堂是民眾集资在原址上修建的。殿堂分上下层，大雄宝殿凝重肃穆，静謐典雅，佛光照耀。大殿里“看破放下自在随缘念佛，真诚清净平等正常慈悲”更让人恬淡心静。松柏依然苍劲，晨鐘暮鼓依然远近可闻。

每年农历二月初八、初九，十月十二、十三日是石佛寺的古庙会日，游人如织。